警队的“绝密档案”,是指至今仍未侦破,科学查证又不能合理解释的悬疑案件。阳任职警察部专案小组十多年,对这些谜题甚感兴趣,奈何职权所限,遂决定与好友Judy请辞警队并成立天眼研究所。成立第一天,一位神秘人物出现,提供经费并留下Helen的失踪档案。经调查后,二人发现Helen与失落文明玛雅文化有关,考古学家推论这文明乃外星人所建立,更与末日预言扯上关系挠腋窝一直挠到哭,本片讲述了行侠仗义的男主叶卓铲奸除恶,在捣毁恶势力团伙黑龙帮后远渡重洋,于唐人街破灭三合会与太阳公司的“机芯武士”计划,同时摧毁了恶势力背后巨大阴谋的一系列传奇故事。