在谋杀案的法庭上,莫里亚蒂教授在福尔摩斯到达前几秒钟被释放,太迟了,有重要证据。自由莫里亚蒂誓言福尔摩斯,他的下一个犯罪的人会如此残忍和令人惊讶,福尔摩斯的声誉将完成。莫里亚蒂集关于残忍的阴谋的皇冠上的宝石和一系列的谜团让福尔摩斯的心。叶罗丽,日本警视厅特殊部队(SIT)小队长濑文焚流(加濑亮饰),在一次执行任务时遭遇队友的离奇死亡,面对高层他百口莫辩,最终被调职到公安部公安第五课——不明事件调查科。该部门专门调查一些匪夷所思的超自然案件,当然在所谓“科学昌明”的现代化社会,这也意味着第五课是一个很难得到认可的边缘部门。除濑文外,第五课只有油滑的上司野野村光太郎和智商高达201的怪女孩当麻纱绫(户田惠梨香饰)。在此期间,预言师、神之手等各种各样拥有超能力(SPEC)的人物接连登场。濑文在和当麻办案的过程中,渐渐趋近了一个鲜为人知且充满阴谋和秘密的未知世界。